杨戬奉师父玉鼎真人之命投奔师叔姜子牙讨伐商纣，杨婵被女娲圣尊收为座下弟子，并将唯一的慈爱圣器宝莲灯传授给杨婵，女娲圣尊视杨婵为亲生儿女一般，只因杨婵心善如大地之母，在传授宝莲灯心法秘诀时，女娲圣尊发现宝莲灯内暗藏新天条，开启新天条之人与杨婵有血缘关系，就连女娲圣尊都无从得知究竟新天条出自何人之手。
女娲圣尊道:“婵儿，本尊将宝莲灯心法秘诀传授于你，你要勤修苦练，待你修炼完成之后要下山助你二哥杨戬讨伐帝辛，还要与你二哥杨戬去往桃山救出你们的母亲，救出你们的母亲之后你要回到本尊座下继续修炼，待封神大会结束后，你要到人间的道场去镇妖除邪。”杨婵回禀女娲道:“徒儿谨遵师尊之命，刻苦修炼宝莲灯心法秘诀。”女娲圣尊观看杨婵的面相道:“婵儿，师尊从你面相得知，日后会有一场劫数降临你身，至于是甚劫数，此乃天机不可泄露。”杨婵听了师尊女娲的说教就回到自己的修炼处进行了刻苦的修炼。
欲界之神瑶姬因思凡下界触犯天条被紫薇大帝与天蓬元帅带回天庭，将瑶姬押至在天庭凌霄宝殿玉帝面前，玉皇大帝让所有神将都退出凌霄宝殿，只留下太上道祖站在旁边，让妹妹瑶姬跪在凌霄宝殿中央，玉皇大帝问妹妹瑶姬道:“瑶姬，你原本是天庭欲界之神，管辖诸神的欲望，不让诸神思凡下界，如今你却触犯天规，私自下界与凡人成亲，你可知罪否。”瑶姬答道:“玉帝，瑶姬无罪。反倒是玉帝该修改天条了，天条太过陈旧腐朽，抱着冰冷而腐朽的天条不放，只会让众天神对玉帝陛下不满。”瑶姬刚说完，就见太上道祖点了点头，太上道祖心语道:“是时候该孕育新的天条了，只不过开启新天条之人还没出生，瑶姬，你必有一劫数到来。”
玉皇大帝听了妹妹瑶姬说的话，心中升起了废除旧天条建立新天条的博爱之念，可就在此时凌霄宝殿上空突然传出一声远古天帝少昊之灵对玉皇大帝的警告:“穹高，休得放肆，此天条乃本尊所设，岂能任由你们随意废除。”警告之声刚落，就只见一道雷电从高空降临劈向瑶姬，将瑶姬从凌霄宝殿直接劈下界，紧接着蟠桃树上的一颗桃子也被雷击掉落凡间，化作桃山将瑶姬压至山中。
太上道祖见此情震怒大喊道:“恶帝少昊，本尊在此，休得放肆！你的肉身即已被远古战神刑天所灭，就当魂飞魄散才是。如今的天庭已不是远古的天庭了，天帝也不是你了，而是本尊所封禅的:高天上圣玉皇大天尊玄穹高上帝，恶帝少昊，不得造次。你所制定的天条过于陈腐，这才引发了远古屠神大战，致使三界生灵涂炭，直到如今你还不知悔改，来，让本尊将你化为乌有。”
太上道祖话音刚落就使出了道家无上心法，直奔向少昊之灵打去，由于太上道祖是道德天尊的分身，其使出的道家无上心法，根本达不到消灭少昊的力量，反而让少昊控制了玉皇大帝的心智，从此天庭又回到了远古时期的灰暗统治时代。
被少昊之恶灵控制的玉帝，消失了以往的仁慈与博爱，多了份残忍与邪恶，传旨要惩罚三界众生，命令下界的瘟魔在凡间传播瘟疫，此事让元始天尊得知，元始天尊神威震怒，命令座下弟子火灵真人下山联合姜子牙将瘟魔收降，瘟魔被火灵真人收走以后，其残留下的瘟疫还没被治愈。
此时正是下界在讨伐商纣的时代，女娲圣尊让杨婵带着宝莲灯下山助西岐消除瘟疫，杨婵手持宝莲灯在去往西岐的路途之中，宝莲灯突然闪现一位身穿长袍的修道之人，并显示这位道长就是治愈瘟疫之人，于是杨婵就跟随着宝莲灯发出的光来到了神农山百草洞，见道长正在用法术制造药丸呢，这位道长就是道德天尊座下大弟子神农真人。
神农真人看了看杨婵向她说道:“你就是女娲圣尊的弟子杨婵吧，我们赶快走，去西岐治瘟疫。”杨禅道:“请问道长是谁，怎么知道我师承女娲圣尊？”神农真人道:“贫道乃道德天尊大弟子，神农真人。”杨禅道:“原来是神农师兄啊！神农师兄，救人之事不宜迟缓，咱们边走边说。”杨婵与神农真人驾着云来到了西岐军帐之外，神农真人向西岐士兵道:“快去禀告你们的姜丞相，就说他的师兄神农真人为西岐解燃眉之急来了。”神农真人说完话，就让士兵吃了一粒瘟百解丹，该士兵的瘟情就从此治愈了，该士兵回到营帐里向姜丞相如实禀报，姜子牙问听是神农师兄到此，就立即起身来到帐外迎接神农真人，姜子牙道:“神农师兄，自昆仑一别，子牙甚是想念。请进，到营帐之内商讨治愈全军瘟疫之事，商讨完毕之后，子牙为师兄接风洗尘。”
火灵真人将瘟魔收回之后，感觉有些不对劲，便掐指一算，这一算方才得知瘟魔只是一个小角色，瘟魔背后还有真正的操控者，火灵真人即刻下山再一次来到西岐，见神农真人也下山来到西岐。
火灵真人道:“神农师兄，你也来帮助子牙师弟和姬侯爷消灭瘟疫？”神农真人道:“火灵师弟，你所带回的并不是这次瘟疫的真正主谋，所以你这次下山是为了将真正的主谋带回一并消灭。”
火灵真人道:“难道神农师兄知道是谁在操控这场瘟疫？”这时杨婵在一旁回答火灵真人道:“火灵师兄，瘟疫背后的操控者就是远古时期被炎火天帝镇压在祝融山的瘟皇，所以这次收复瘟皇之战是很艰巨的一次战役。”
火灵真人道:“没错没错，请问这位圣姑师承何人，既然能知瘟皇的来历？”神农真人答道:“火灵师弟，这位不是什么圣姑，是我们的师妹，名唤杨婵，师承女娲圣尊。”神农真人介绍过师妹杨婵后，就与姜子牙一同在军帐内开始商讨对付瘟皇的绝佳计策。
与此同时，转过思维来说一说被恶帝少昊之灵统治的天庭，少昊之恶灵附着在玉皇大帝体内，控制着玉皇大帝的所有思想与行动，就连太上道祖也拿少昊之恶灵无丝毫办法，任由恶灵控制着玉皇大帝在天庭肆意妄为。
玉帝传旨让紫薇中天北方大帝来凌霄宝殿，平时紫薇大帝就是玉帝的御前大护卫，恰巧这天紫薇大帝没有在紫薇大殿中，就没有及时的接到玉帝的圣旨，这让少昊之恶灵看到了诬陷紫薇大帝的机会。
便立即传圣旨要将紫薇大帝关进天庭死牢，紫薇大帝听到玉帝要将自己关入死牢，便反下天庭直入凡间，正好遇见受了重伤的少年姬发，紫薇大帝将元神完全融入在姬发之身，这才逃过玉帝的追杀，正是如此才有日后的武王伐纣。
原本仙境正道的天庭与凌霄宝殿，被远古天帝少昊的恶灵统治的腐朽而败落，除了太上道祖、天蓬元帅、卷帘大将和月宫仙子嫦娥以外，天界众神都在逐渐走向腐朽败落的处境。元始天尊用慧眼查出天界被少昊的恶灵统治，想要立即惩处恶灵少昊，但掐指一算得知，此乃天界大帝穹高的倒数第二次浩劫，若想破除此劫，仅需两人方可拯救天界，能使天界重归正道。
在下界由于瘟疫四处横行，造成许多平民百姓因瘟疫而横尸遍野，就连西伯侯的二公子姬发都染上了瘟疫，还好紫薇大帝的元神和姬发的凡体融会贯通成为一体，这才拯救了未来讨伐帝辛建立周王朝的武王姬发。
火灵真人与神农真人运用太极八卦阵精心研制出一套云火阵，将此阵设在中原大地的正中央，阵内充斥着炙热的三味真火，阵外则笼罩着一层又一层的云雾缭绕，上方又有太极八卦图所镇压，此阵的所设之地就是瘟皇的出入之界。
姜子牙道:“两位师兄，这些天为了研制这云火阵，真是辛苦你们二位了。”火灵真人与神农真人异口同声的说道:“子牙，我们并不辛苦，辛苦的是杨婵师妹啊！她为了能研制出云火阵已经好几天都没有进食和休息了。”
姜子牙看到杨婵累倒在军帐内的桌子上昏睡，就走上前拿了自己的斗篷给师妹杨婵披上，给师妹杨婵披上自己的斗篷后，姜子牙就连同二位师兄到云火阵外等候着瘟皇的出现，就在此时杨戬回到了姜丞相的军营里，看到了妹妹杨婵。
这时杨婵已经醒了，在营帐里用宝莲灯调试气息，杨戬不敢打扰三妹杨婵调试气息，就站在营帐外面看着三妹调试完气息才进营帐，进入营帐后，兄妹二人相认，杨戬与三妹杨婵就坐在了营帐内说起家常来。
杨婵问二哥杨戬道:“二哥，你什么时候到西岐帮助我姜师兄攻打朝歌、讨伐帝辛的啊！”杨戬惊讶的问三妹杨禅道:“三妹啊，你怎么能称呼丞相为师兄呢？姜丞相是为兄的师叔啊，敢问三妹，师承哪位圣尊？”就在此时，姜子牙和二位真人从云火阵外回到军营之内。
姜子牙向师侄杨戬答道:“杨戬啊，你三妹杨婵说的没错，师叔我就是她的师兄，只因你三妹杨婵拜在了女娲圣尊门下为徒，所以我们便成了师兄妹，但是出于人道你们还是兄妹关系，杨戬、杨婵切记不要违背了人道与天理。”
杨戬兄妹二人向姜子牙尊道:“尊丞相之命，我们兄妹二人一定尊天理守人道，好好辅佐姜丞相讨伐帝辛、兴周伐纣。”姜子牙与火灵和神农两位真人觉得杨戬兄妹对人道与天理的悟性极高，都为他们兄妹俩感到欣慰，可就在此时，营帐外面一阵狂风袭来，随着狂风的吼叫声传来了一阵刺鼻的气味，姜子牙与两位真人立刻来到云火阵外，瘟皇正在冲击云火阵，姜子牙用杏黄旗暂将瘟皇镇压。
再转过思维来看看已经腐朽不堪的天庭，被控制的玉皇大帝现如今已经彻底走向了残忍与腐败的深渊，天庭原有的一百多位天神也随着天庭的腐败而走向了一条不归之路，众神为了一己之私不惜与妖魔为伍，残害三界众生。
玉皇大帝乃整个三界的九五至尊，但却为了控制全人类开金口将瘟皇封为瘟圣天尊四方大帝，让瘟皇将原来刚正不阿的四方大帝取而代之，只因紫薇大帝被贬下凡去，其他三位高圣大帝也纷纷下界灵投在凡间，为日后的封神做准备。
受天帝少昊之恶灵控制的玉皇大帝，变的毫无仁慈与道德，有一日在凌霄宝殿天蓬元帅勇于进言道:“启奏玉帝陛下，如今下界瘟疫肆虐，三界众生都已变得苦不堪言，众生都是陛下您的子民，陛下不能不管啊，而且还将散布瘟疫的妖魔封为天尊大帝，陛下这是在倒行逆施啊，这是违背道德天尊交于陛下的旨意，陛下就不怕道德天尊降罪于你吗？”
天蓬元帅话音刚落，就听得凌霄宝座上传出一声震怒道:“大胆天蓬，竟然冲撞天帝威严，来啊，将天蓬打入天河永不录用。”就这样天蓬元帅被永久的关在了天河水府，永远不让天蓬元帅再上朝进言。
在下界被杏黄旗和云火阵所镇压的瘟皇突然功力大增，闯出了火灵真人与杨婵所设的云火阵，还将杏黄旗振飞回到姜子牙的手中，姜子牙道:“这杏黄旗怎么飞回来了，难道？”姜子牙掐指一算道:“不好！云火阵。”就立刻来到云火阵所设之处，却看到云火阵已毁于一旦。
这时天空出现了一起声波，是元始天尊的隔空传音，元始天尊于弟子姜尚说道:“姜尚，本尊已经知晓这瘟皇的来历，特来赐你一件远古神兵。此神兵乃远古神王盘古所化之物，此物名讳打神鞭，乃盘古肋骨所化，本尊将此神物赐予你，此物可以打天帝除邪魔，就是让你主持封神大会，并管辖诸神。姜尚，伸出你的双手，本尊将封神榜连同打神鞭均赐予你，日后在讨伐商纣的战役中牺牲的道友都会归入这封神榜中，由你姜尚将他们一一封神，姜尚切记，本尊去也。”
元始天尊话音刚落，就只见从空中降下了封神榜和打神鞭落入姜子牙手中，姜子牙向师尊道:“师尊慢走，子牙明白。”姜子牙向元始天尊告别之后就回到了军营之中，就启用无字天书开始修炼打神鞭，为消灭瘟皇攻打殷商而准备。